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MicroBiome芯片


微生物組分析芯片(Microbiome Array),由 Affymetrix 與勞倫斯利福摩爾國家實驗室(Lawrence Livermore National Laboratory)合作開發,利用簡單易用的軟件在可擴展的平臺上實現菌種和菌株水平的檢測。

利用 Axiom Assay 生物化學技術,基于NCBI 數據庫序列數據分析科保守區域和靶標特異性區域的非多態性序列,可檢出 11,000 多種微生物,包括古生菌、細菌、真菌、原生動物和病毒,在單次試驗即可檢出樣品中的所有已知微生物。

Axiom? Microbiome Array芯片內容對樣品類型沒有限制,適用于營養基因組學、農業基因組學和動物研究與建模。


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技術特點


1.芯片中含有針對 11,000多種微生物而設計的探針

2.全面覆蓋五大微生物群體:古生菌、細菌、真菌、原生動物和病毒

3.可實現菌種和菌株水平的檢測; RNA 病毒檢測使用cDNA作為模板

4.可擴展的平臺,配合簡單易用的分析軟件

5.芯片板有 24 和 96 兩種規格可以選擇


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技術流程


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技術應用


1.營養基因組學研究(包括微生物群落對營養和飲食健康的影響)

A.探索人類腸道微生物群與疾病狀態(例如,潰瘍性結腸炎、腸道炎癥和心血管疾病)之間的關聯

B.對益生菌和益生元混合物進行高分辨率分析,來分析它們對人類腸道菌群的影響

2.農業基因組學

A.通過評估動物腸道微生物群落優化投喂

B.評估微生物群落對土壤生產力的影響

C.家畜健康狀態檢查

3.動物研究與建模

A.通過微生物分析檢測病原體

B.動物園篩查(環境監測和動物菌落健康狀態監測)

C.疾病預防

D.微生物狀態和療效評估


項目周期


芯片有24和96兩種制式可選,中玉金標記從收到樣本到完成客戶所需的分析需要一個月左右,如果客戶需要定制化服務則可能需要更長的時間。



參考文獻


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