我們是,開放的分子育種平臺

Successful case

科研解決方案

首頁 > 科研解決方案 > QTL定位

QTL定位-技術概述


使用在目標性狀上顯著不同的雙親本構建性狀分離群體,例如自交群體、回交群體、重組自交系群體等。

通過對雙親本群體進行基因型檢測,結合表型數據對目標性狀進行QTL定位。

QTL初定位一般基于低代的群體,能夠得到一個比較大的定位區段。

QTL精細定位通過提高群體代數、縮小連鎖區段、加密分子標記來逐漸縮小QTL定位區段,并最終完成基因定位與克隆。



qtl02.jpg

技術特點


與其他類型的基因定位方法例如GWAS等相比,雙親群體QTL定位有以下特點。

基于自然群體的GWAS分析需要面臨由于群體結構而帶來的定位結果假陽性問題,而雙親本QTL定位則不需要考慮群體結構問題,遺傳背景噪音相對較小。

雙親本群體的構建相對直接,只需要找到在目標性狀上有顯著差異而且遺傳背景最好不要太遠的一對親本即可,不需要進行大規模的自然群體收集。

QTL初定位由于分離區段相對較大不需要密度太高的分子標記,而QTL精細定位只需要在特定區段進行標記加密即可,所以雙親群體QTL定位所需要的分子標記檢測量相對比較少。


qtl03.jpg

qtl04.jpg

技術流程


qtl05.jpg

精細定位


1.提高雙親群體代數

2.在目標區段設計雙親多態性KASP標記

3.反復縮小定位區段直至找到功能基因


blob.png

技術應用


中國農業大學徐明良老師實驗室基于一個雙親群體,對抗絲黑穗病基因qHSR1完成了從初定位、精細定位、品種改良、基因克隆的完整工作,最終的基因克隆文章發表于Nature Genetics期刊。qHSR1定位群體的雙親本是抗病親本Ji1037和感病親本黃早四。文章Chen et al. 2008基于BC2:3和BC2F2群體將qHSR1初定位到bin2.09上大約2Mb的區段。后續工作進一步將qHSR1精細定位到了大約152kb的區段內。另一篇文章Zhao et al. 2012描述了將qHSR1導入10個國內玉米自交系改良絲黑穗病抗性,結果顯示在自交系和雜交種的層面上都帶來了明顯的抗性提升,與此同時大部分農藝性狀沒有發現影響。Zuo et al. 2014最終發表了qHSR1基因克隆與基因功能機制研究結果,該文發表在Nature Genetics期刊。


blob.png


blob.png
blob.png
blob.png

重庆时时彩稳赢的公式