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科研解決方案

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轉錄組測序

轉錄組測序項目通過對生物樣本表達的全體轉錄本RNA進行序列測定,分析包括編碼和非編碼基因的所有轉錄活動,在全基因組水平對轉錄調控過程進行定量研究。

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2009 Wang, RNA-Seq a revolutionary tool for transcriptomics

項目特點


與基因表達芯片技術相比,轉錄組測序除了可以提供更為精確的基因表達定量信息,更大的動態范圍以外,還可以發現新的轉錄區域、可變剪切形式及反式剪切轉錄本(融合基因)。

轉錄組測序提供的表達定量信息,可用于分析不同條件下基因、轉錄本水平的表達差異,進而結合功能基因組數據對差異表達基因進行功能注釋和網絡互作、代謝通路分析,為重要生物學過程的調控機制研究提供基礎。

同時,轉錄組測序還可用于發現轉錄區域的SNP和indel等多態性位點,并結合RNA定量信息分析不同等位基因的表達差異,研究遺傳因素對表達調控的影響。


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項目流程


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項目時間


從收到樣本到完成客戶所需的分析一般需要 30天 到 60天 不等,如果客戶需要訂制化服務則可能需要更長的時間。

經典案例


Brutnell研究組對玉米葉片不同發育階段的四個樣本以及由激光顯微切割得到維管束鞘和葉肉細胞組織樣本的進行轉錄組測序,對玉米葉片發育過程中的轉錄組動態進行了系統研究,描述了葉片發育過程基因表達調控規律,并對其分子機制進行了探討。 

技術路線總結:

1.針對特定生物學過程的收集組織樣本

2.對樣本進行轉錄組測序

3.通過生物信息學分析對各階段的基因表達水平進行定量,鑒定差異表達基因

4.分析生物學過程中不同基因的表達模式

5.對不同表達模式的基因進行進一步的功能分析,探索表達調控機制

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